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干货!5步教你跑出漂亮的大分子WB图

发布时间:2025-02-03
浏览次数:7639
作者:东极药物

如果你研究的蛋白分子量比较大(大于150KD),苦于一直跑不出好看的western-blot,那么这篇文章一定适合你!01选对凝胶很重要3种最常见的凝胶包括Tris-Glycine, Bis-Tris and Tris-Acetate.Tris-Glycine凝胶的PH为8.···


如果你研究的蛋白分子量比较大(大于150KD),

苦于一直跑不出好看的western-blot

那么这篇文章一定适合你!

01 选对凝胶很重要

3种最常见的凝胶包括Tris-Glycine, Bis-Tris and Tris-Acetate.

  • Tris-Glycine凝胶的PH为8.6,且保质期很短。在跑胶的过程中,PH还有上升的趋势,可达到9.5。这会导致蛋白降解和低分辨率。

  • Bis-Tris凝胶的PH为6.4,相对Tris-Glycine凝胶,稳定性和保质期都有所增加。但这种凝胶需要在溶液中增加抗氧化剂,比如DTT,以维持蛋白的还原性。

  • Tris-Acetate 凝胶的PH为7,跑大分子蛋白会呈现很高的分辨率。

  • 所以跑大分子蛋白时,我们推荐使用Tris-Acetate 凝胶!

02 凝胶浓度很重要,可使用梯度凝胶

既然选择了Tris-Acetate 凝胶,还有几个要考虑的问题。

  • 胖友们知道,凝胶浓度与孔径成反比:浓度越小,孔越大。较大的蛋白质更容易通过较大的孔,所以试剂君建议使用低百分比的凝胶,如7%。

  • 可以使用梯度凝胶,梯度凝胶非常适合新样本。但是制作梯度凝胶会恨棘手,需要一个梯度凝胶装置,不过现在很多公司都会出售具有不同范围的预倾倒梯度凝胶,大大节省了胖友们的时间。

03 提高转移buffer中的SDS,减少甲醇

转移buffer的组成至关重要。如果有甲醇存在,大分子蛋白很容易沉淀。通过减少转移buffer中的甲醇百分比(10%或更低)来避免这种情况发生。为了进一步确保蛋白质不会沉淀,考虑添加SDS至终浓度为0.1%。SDS向蛋白添加均匀的负电荷,使得它们更容易从凝胶转移到膜上。

04 选择合适的膜

膜一般有PVDF膜或NC膜,跑大分子蛋白选择PVDF膜。

如前面所说,如果有甲醇存在,大分子蛋白很容易沉淀。而PVDF膜不需要在转移buffer中添加甲醇,目的蛋白转印的机会更高。

PVDF膜有各种孔径尺寸,最常见的是0.2um和0.45um。与凝胶一样,较大的蛋白比较小的蛋白更容易穿过大孔隙。大多数蛋白质(> 20kDa)可以用0.45um膜转移,避免使用0.2um孔径。

05 增加转印时间

在正确的选择完凝胶、转印膜及转移buffer后,转印正式开始。半干转快且方便,但不适用于大分子蛋白。试剂君建议湿转,因为大分子蛋白转移时间很慢,推荐350-400 mA转移90min或 4°C,40 mA,转印过夜。

但有的大神在实践中验证,接近200 KDa的蛋白(如EGFR),使用半干转的效果也不错。而根据大的说法,像mTOR这种直逼300 KDa的蛋白,只要优化半干转的条件,也照样能做出结果(如按照仪器内置的程序设定转印一次,暂停冷却一段时间,再转印一段时间)。

所以湿转、半干转胖友们结合自己的经验决定,但增加转印时间是必须的~

小贴士

BSA通常作为NC膜的封闭液,但是对于PVDF膜,它的封闭效果并不好。因此这边建议,在封闭PVDF膜时选用0.5%的酪蛋白(Casein)。

具体操作如下:将酪蛋白加入缓冲液中,然后在加热板上加热至80℃或直到溶解;不要煮沸溶液。在使用前冷却至25-40℃。

另外,不要让膜在检测过程中的任何时间点干透,如果膜部分变干,可以让膜完全干掉,然后用甲醇重新润湿,之后用缓冲液浸泡,继续操作。


文章出自:实验外包   想了解更多请关注:http://www.dj-cro.com/

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